Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NXNL1Q96CM4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXNL1Q96CM4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms