Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N3U1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N3U1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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