Protein–RNA interactions for Protein: Q5SGD2

PPM1L, Protein phosphatase 1L, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1LQ5SGD2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1LQ5SGD2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1LQ5SGD2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.9 ms