Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COTL1Q14019 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COTL1Q14019 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms