Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL6Q02878 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL6Q02878 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms