Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GNB1P62873 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GNB1P62873 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNB1P62873 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNB1P62873 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNB1P62873 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms