Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA3P35244 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA3P35244 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA3P35244 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA3P35244 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA3P35244 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA3P35244 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA3P35244 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA3P35244 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA3P35244 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA3P35244 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA3P35244 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA3P35244 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA3P35244 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA3P35244 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA3P35244 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA3P35244 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA3P35244 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA3P35244 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms