Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SSFA2P28290 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSFA2P28290 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms