Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FCER1AP12319 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms