Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF3O75054 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms