Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMBP3BA6NNM3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMBP3BA6NNM3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms