Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE9

PRSS29P, Putative serine protease 29, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS29PA6NIE9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS29PA6NIE9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRSS29PA6NIE9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms