Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CGGBP1Q9UFW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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