Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDAP2Q9NXN4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDAP2Q9NXN4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms