Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BSDC1Q9NW68 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BSDC1Q9NW68 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BSDC1Q9NW68 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms