Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms