Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9AQ99638 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD9AQ99638 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD9AQ99638 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms