Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGD4Q96M96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms