Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CNBD2Q96M20 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms