Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms