Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM43Q96BQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM43Q96BQ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM43Q96BQ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM43Q96BQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms