Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC13Q8IYE1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC13Q8IYE1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms