Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP30Q70CQ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms