Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRIP3Q6Q6R5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRIP3Q6Q6R5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms