Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC62Q6P9F0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms