Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF19Q5T6S3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF19Q5T6S3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms