Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TIMM23BQ5SRD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM23BQ5SRD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM23BQ5SRD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms