Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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EXT1Q16394 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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EXT1Q16394 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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EXT1Q16394 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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EXT1Q16394 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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EXT1Q16394 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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EXT1Q16394 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EXT1Q16394 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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