Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
EEA1Q15075 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
EEA1Q15075 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
EEA1Q15075 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
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