Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNF4GQ14541 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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