Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SREBF2Q12772 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SREBF2Q12772 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 512.4 ms