Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms