Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX5P78411 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX5P78411 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX5P78411 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX5P78411 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX5P78411 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX5P78411 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRX5P78411 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX5P78411 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX5P78411 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX5P78411 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX5P78411 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX5P78411 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms