Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH6P55285 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH6P55285 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH6P55285 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH6P55285 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH6P55285 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH6P55285 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH6P55285 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH6P55285 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH6P55285 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH6P55285 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms