Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRNPP04156 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRNPP04156 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRNPP04156 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRNPP04156 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRNPP04156 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRNPP04156 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRNPP04156 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRNPP04156 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRNPP04156 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRNPP04156 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRNPP04156 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRNPP04156 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRNPP04156 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRNPP04156 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRNPP04156 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRNPP04156 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRNPP04156 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRNPP04156 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRNPP04156 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRNPP04156 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRNPP04156 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRNPP04156 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRNPP04156 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRNPP04156 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRNPP04156 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRNPP04156 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRNPP04156 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRNPP04156 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRNPP04156 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRNPP04156 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRNPP04156 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms