Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RECQL4O94761 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RECQL4O94761 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RECQL4O94761 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms