Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ARID3CA6NKF2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARID3CA6NKF2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms