Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCCD1A6NED2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCCD1A6NED2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms