Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC78A2IDD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms