Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM7Q9UK45 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM7Q9UK45 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms