Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO1B3Q9NPD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLCO1B3Q9NPD5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO1B3Q9NPD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO1B3Q9NPD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO1B3Q9NPD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms