Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLK3Q9C098 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK3Q9C098 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK3Q9C098 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms