Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC3Q9BY71 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC3Q9BY71 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms