Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNG6Q9BXT2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms