Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS2Q9BXC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS2Q9BXC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms