Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFDN5Q99471 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms