Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3KBP1Q96B97 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms