Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC13Q8IYE1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC13Q8IYE1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms