Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF613Q6PF04 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF613Q6PF04 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms