Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CC2D1BQ5T0F9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CC2D1BQ5T0F9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms